Biovision s’engage pour une gestion professionnelle des projets et vérifie par un système de gestion interne que les ressources sont employées de manière judicieuse. Biovision confie la réalisation des projets de base en Afrique à des organisations partenaires locales. Les projets sont élaborés en commun, préparés, réalisés et remis progressivement aux bénéficiaires. Tout ce processus est accompagné par les responsables du programme et du projet. Le compte rendu et le contrôle des activités est assuré par un système détaillé de gestion et d’évaluation.

Les finances sont soumises à un strict contrôle interne et externe. Les projets soutenus par Biovision sont aussi vérifiés et évalués par des intervenants externes.